なんと返事するべきでしょうか

ヤンジャン(笑)　そういう女性もいるんですね。もうそこには触れずに違う話したほうがいいですよ！　

「マンガを全く読まないので、ヤンジャンが何のことだか全くわかりません」という言い方がキツい。メールって顔見えないしどんなテンションで言ってるかわからないから気をつけないと…。だから女性も謝ったんだと思います。
まず「ヤンジャン」でググれば何なのか分かるし、どういう漫画が連載されてるかも分かるから、そこから「普段あまり漫画読まないので、知らなくて調べたんですけど、ヤンジャンで連載している○○っていう作品は○○について話みたいなので自分も興味あります！面白そうですね。今度読んでみようかな〜」くらい言えたのでは。
そもそもマンガ読まなくて話広げられないなら「なんのマンガ読んでるのか」を質問したこと自体謎ですけど。。

もっと興味を示してあげては？
そのマンガの魅力であるとか、どんなジャンルのマンガであるとか。
それで興味わかなければ別の話題に変えれば良いと思います。

「いえいえ、自分から聞いておいてこちらこそすみません！その漫画面白いですか？」ではないでしょうか
自分が全く漫画を知らないのに何の漫画か聞いておいてそれはないのでは？対面ならまだしもメッセージでのやりとりならヤンジャンが何か調べることもできたろうに。
あなたの関心ごとを詳しく聞かれて、ふーん、でも私全然興味ないんです、と返されたらじゃあ聞くなよ、となりませんか？お相手はとても大人な対応ですね。

またコミュ障かよ30にもなって(笑)

そのくらいググって話盛り上げろよ・・・。
だからモテないんだろ。