遠方から会いに来て下さる男性

感謝するだけでいいと思いますよ
あるいは、デートでお気に入りのお店を紹介して一緒にいくとか
男性目線ではそれで全然OKです

貴女に会いたいのはお相手です！無理に来てくださってる訳では無いかと思いますよ。精神誠意感謝を伝えることが大切だと思います。そしてせっかく来られたからと無理にお付き合いすると反対に傷付けると思います。手土産は断られた相手からは頂きたくないものです。私は食事代と感謝の気持ちを書いた手紙を封筒に入れて用意しておきました。また会いたいと思ったら次は私が案内するねでよいのでは？

なにかしてあげようと思われることは良いと思います。
ですが相手の収入に対して、労いの意味でお茶代とか（なぜ食事代じゃない？）、まして手土産に年収差なんて関係ないと思いますけど。

気持ちがあれば食事でも手土産でも、何なら両方でも良いと思います。
逆に金持ちだから男性持ちね！と考える女性よりマシではないでしょうか。

お相手はアプリで何度か会っていてまだお付き合いに至ってないんでしょうか？
それともお付き合いされてる方でしょうか？

いずれにしても嫌なら会いに来られないと思いますし、そこまでして会いたいと思っておられるって事でしょうから気にされる事はないと思います。

「遠い所を…」労うだけで十分だと思います。

もし、お付き合いされているのであれば、食事代やお茶代よりもちょっとした手土産でも喜ばれると思います。

まだお付き合いに至ってないのであれば、そういった行為はお相手に過度な期待を持たせてしまう事になるので、お断りする時にお断りしにくくなるかもしれませんので、あまりお勧めしません。