質問者様の仰る通り、笑って見送るのが良いのではないでしょうか。

付き合ってすぐの頃は、男性は彼女を優先してくれると思いますが、3ヶ月経って、彼氏さんの気持ちにも余裕が出てきたのだと思います。信頼しているというか、甘えているというか。

また、仕事の付き合いはなかなか断れないし、友人の飲みも断り続けると、あいつは付き合いが悪いと思われてしまうようです。(と、以前の彼が言っていました。)

でも今まで一緒にいたぶん、質問者様は寂しいですよね。
重くならない程度に寂しいよと伝えるのは大事なことだと思います。寂しい、悲しいという気持ちはきっと彼に伝わるはずです。伝えた上で、彼が外出するときは楽しんできてねと、笑顔で見送りましょう。

一緒に食べられるときは彼の好きなものを作って、やっぱり一緒に食べる方がいいなと思わせるのもいいかもしれませんね。

笑って見送るべきかどうか、に関しては、その方が良いと思います。
週に２回程度であれば、本当に付き合いだと思いますし。

ただ、普段から帰りが遅く、ラインの返事もないのは相当不安だと思います。
なので、帰りが早いのか遅いのかの連絡だけは欲しい、くらいは甘えてもいいと思います。
それすら渋るような彼氏なら、思い切って他の彼を見つけることも考えましょう。
一緒になって、幸せになれる未来が思い描けないのであれば、
諦めることも肝心です。

とても良くわかります。
うちは、お恥ずかしい話
それで揉めに揉めました。

うちの場合は、私自身は束縛されていたので
不服を訴えたんです。

男尊女卑だって訴えて
寂しいって言ったら

俺が悪かったって言ってくれました。

付き合いを断れないというのは
言い訳でしかないよなって言ってました。

それで離れてくならそれまでの関係なんだとも
言ってました。
今では私を交えて遊びに行くやら
うちにお招きするやらになりました。

同じことをしてみたらいかがですか⁇
男性は自分がやっていることを
やられないと分かりません。

彼が家に帰ってる日に
急に友人から誘いが入って断れない。と
友人でも誘って朝まで帰らなければ
分かってくれるかもしれませんよ。

私の場合、それで謝らせました。
お前が待っていない部屋がこんなに寂しいなんて
思わなかったって言われました。

彼が安心しきってる証拠ですよ。

喝を入れてやった方が良いかと思います。

前まで真っ直ぐ帰ってきてくれてたから、寂しい気持ちになるのはわかりますが、週2回くらいなら彼氏にも付き合いがあるわけですし、仕方ないと思います。
ただ、寂しいから早く帰ってきてねくらいは言ってもいいと思いますけどね！

本当のことが知りたいのなら、彼氏の前では何にもないように笑顔で振る舞い、こっそりと小型のGPSを仕込ませましょう(*^^*)
そんなのやりすぎだ！と思う人もいるかと思いますが、不安にさせる方が悪いです。連絡の一つくらい、あってもよいはずです。
わたしの場合は、怪しいなと思ったら、やっぱり浮気でした。
質問者さんも、気になることがあるなら、うやむやにせず、白黒はっきりさせるべきだと思います。